大多数GAG降解酶是属于多糖裂解酶（CAZY分类，Polysaccharide Lyases），其主要作用于阴离子多糖，通过β消除机制降解糖苷键以产生具有C4-C5双键的不饱和寡糖，其在232nm波长处有吸收，因而可用于产物的检测及酶活性的测试。我们生产的借助大肠杆菌宿主重组表达的来自大肠杆菌噬菌体的K5裂解酶A和来自肝素黄杆菌（Flavobacterium Heparinum）的肝素酶I，II，III，具有很高的纯度以及肝素或硫酸乙酰肝素的降解活性。 K5裂解酶A特异性降解K5多糖以及硫酸乙酰肝素中的NAc区域。肝素酶I则降解肝素和硫酸乙酰肝素的S-结构域，并且主要裂解低硫酸化区域。肝素酶II则对肝素和硫酸乙酰肝素均具有广泛的特异性。而肝素酶III仅作用于硫酸乙酰肝素。它只切割高硫酸化区域。组合使用肝素酶则可以将肝素或硫酸乙酰肝素几乎完全解聚成二糖成分。
自普通变形杆菌（Proteus vulgaris）的借助大肠杆菌表达纯化的重组硫酸软骨素酶ABC I，II能高度特异性的催化内切 - （I）或外切 - （II）消除对半乳糖胺聚糖（galactosaminoglycan，GAG）多糖的降解，例如硫酸软骨素和硫酸皮肤素，但对硫酸角质素和肝素/硫酸乙酰肝素则没有活性。来自化脓性链球菌噬菌体（Streptococcus pyogenes phage）的大肠杆菌表达衍生的重组透明质酸裂解酶则通过β-消除催化透明质酸降解为寡糖。
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